本文为日文原文的译文。以日文版为准，金额依据日本税法。
年末调整（年末調整）是由公司在12月的工资中结算全年所得税的手续，确定申告（確定申告）是本人在次年2月16日至3月15日向税务署提交的手续［国税厅 No.2020］。绝大多数公司职员只做年末调整就结束了。不过医疗费扣除、捐赠金扣除、杂损扣除以及住房贷款扣除的第一年无法在年末调整中处理，这部分需要做确定申告。反过来，工资总额超过2,000万日元的人，以及年中离职且当年没有再就业的人，连年末调整本身都无法接受［国税厅 No.2665］。两者都需要的人，按"年末调整 → 源泉征收票 → 确定申告"的顺序推进。令和8年分（2026年分）由于基础扣除的提高于令和8年12月1日施行，只有在11月30日之前结束年末调整的人需要通过确定申告结算。本文把两者的区别整理成一张表，并依据国税厅的资料确认自己该在什么时候做哪一个。
结论：年末调整与确定申告的区别在这里
| 年末调整 | 确定申告 | |
|---|---|---|
| 谁来做 | 公司（工资的支付方） | 本人 |
| 什么时候 | 当年12月（支付最后一次工资时） | 次年2月16日〜3月15日 |
| 提交什么 | 扶养扣除等申告书、基础扣除申告书、保险费扣除申告书，交给公司 | 确定申告书，交给税务署 |
| 涵盖的所得 | 只有该公司支付的工资 | 全部所得合并计算 |
| 可用的扣除 | 能写进3张申告书的扣除（见下面的一览） | 左栏的扣除＋医疗费扣除、捐赠金扣除、杂损扣除、住房贷款扣除的第一年 |
| 结算的时期 | 反映在12月（部分公司为次年1月）的工资中 | 申告后退还到指定账户，若有应纳税额则在3月15日前缴纳 |
| 期限 | 在领取当年最后一次工资之日的前一天提交 | 仅退税的话为次年1月1日起5年内。有应纳税额时为3月15日 |
出处：国税厅 No.2020·No.2665·No.2030，令和8年分 年末调整的做法［国税厅（日文）］
一句话概括，年末调整是"只结算工资部分"，确定申告是"把全部合起来重新计算"。年末调整的结果会变成源泉征收票，确定申告时把上面的数字抄过来继续计算。并不是把同样的工作做两遍。整体框架请见公司职员的年末调整与公司职员的确定申告。
年末调整能处理的扣除与不能处理的扣除
交给公司的纸是3张。能写进这3张的扣除就是"年末调整就结束的扣除"，写不进去的则要转到确定申告。
年末调整就结束（只需向公司交表）
- 基础扣除、所得金额调整扣除、配偶（特别）扣除、特定亲属特别扣除［国税厅 样式（日文）］
- 扶养扣除，以及残障人士、寡妇、单亲、勤工俭学学生的各项扣除［国税厅 样式（日文）］
- 人寿保险费、地震保险费、社会保险费、小规模企业共济等缴款（iDeCo）的各项扣除［国税厅 样式（日文）］
- 住房贷款扣除的第二年以后（把税务署寄来的扣除证明书兼申告书交给公司。还需附上金融机构的年末余额等证明书，但如果金融机构采用"调书方式"则不需要）［国税厅 No.1211-1］
年末调整做不了（转到确定申告）
- 医疗费扣除——附上明细书做确定申告［国税厅 No.1120］
- 捐赠金扣除——附上收据做确定申告（故乡纳税有下面的特例）［国税厅 No.1150］
- 杂损扣除——因灾害、盗窃、侵占导致资产受损时［国税厅 No.1110］
- 住房贷款扣除的第一年——只有最初一年必须做确定申告［国税厅 No.1211-1］
故乡纳税（ふるさと納税）是例外。一站式特例适用于不需要做确定申告的工资所得者，且捐赠对象在5个团体以内的情况。一旦申请，所得税不再进行扣除，全额从次年度的住民税中扣除［总务省 故乡纳税门户网站（日文）］。因医疗费扣除等原因要做确定申告的人已不符合特例的前提，所以捐赠金也要写进申告书。
连年末调整本身都无法接受的人
12月年末调整的对象是全年在职的人，以及年中入职并工作到年末的人。以下的人被排除在外［国税厅 No.2665］。
| 不属于对象的人 | 如何结算 |
|---|---|
| 一年内确定应支付的工资总额超过2,000万日元的人 | 确定申告（No.1900） |
| 没有提交扶养扣除等申告书的人（乙栏） | 确定申告。兼职时已向其他公司提交申告书的从属工资也一样 |
| 年中离职且当年没有再就业的人 | 确定申告。多数是多缴，会成为退税申告 |
| 日雇劳动者等（丙栏） | 确定申告 |
| 依据灾害减免法获得源泉征收的缓征或退还的人 | 确定申告 |
出处：国税厅 No.2665、"令和8年分 年末调整的做法"第5〜6页［国税厅（日文）］、No.1900［国税厅 No.1900］
年中离职的人也有例外。①成为非居住者的人②因死亡而离职③因身心有显著障碍而离职的人（预计会再就业的人除外）④领取了12月应发工资之后离职的人⑤兼职等本年度工资总额在136万日元以下的人（当年预计会从其他单位取得工资的人除外），在离职时就会进行年末调整［国税厅 No.2665］。⑤的136万日元是反映了令和8年度改革后的金额。更细的分支整理在无法接受年末调整、不属于对象的人。
两者都需要的人的顺序：年末调整 → 源泉征收票 → 确定申告
医疗费支出较多的年份、买房的年份、捐赠对象达到6个自治体以上的年份，两者都要做。顺序只有一种。
- 10〜11月：向公司提交3张申告书。附上人寿保险费、地震保险费、iDeCo的证明书。医疗费和捐赠金不用提交。
- 12月：公司进行结算。多缴的话会在12月（部分公司为次年1月）的工资中加回来，不足的话会被追加扣除。
- 领取源泉征收票。中途离职的公司那一份，会在离职之日后1个月以内交付［国税厅 法定调书手册（日文）］。
- 次年：把源泉征收票上的数字抄过来做确定申告。只需加上年末调整没能计入的扣除。仅退税的话从次年1月1日起5年内都可以提交，不必等到2月16日［国税厅 No.2030］。
- 只做年末调整——在1家公司任职，没有医疗费、没有捐赠、也没有住房贷款第一年的人
- 年末调整＋确定申告——有医疗费扣除、住房贷款扣除第一年、向6个以上自治体捐赠的人
- 只做确定申告——年收入超过2,000万日元、年中离职后没有再就业、以及乙栏的人
仅限令和8年分（2026年分）的注意点：12月1日施行的改革
令和8年度税制改革提高了基础扣除等金额。改革于令和8年12月1日施行，适用于令和8年分以后的所得税。国税厅也写明"令和8年11月之前的源泉征收事务不发生变化"［国税厅 关于基础扣除的提高（日文）］。
| 项目 | 改革后（令和8·9年分） | 改革前 |
|---|---|---|
| 基础扣除（合计所得489万日元以下） | 104万日元 | 95万〜68万日元 |
| 基础扣除（超过489万日元、2,350万日元以下） | 67万日元／62万日元 | 63万日元／58万日元 |
| 工资所得扣除的最低保障额 | 74万日元 | 65万日元 |
| 扶养亲属·同一生计配偶的所得要件 | 62万日元以下（只有工资时为136万日元以下） | 58万日元以下（只有工资时为123万日元以下） |
出处：国税厅"令和8年4月 源泉所得税改革概要"第1〜2页［国税厅（日文）］
扶养亲属等所得要件的改革适用于令和8年12月1日以后支付的工资。有家人新符合要件的人，要重新提交扶养扣除等申告书，在"异动月日及事由"栏填写"令和8年12月1日 改革"［国税厅 Q＆A Q2-1（日文）］。
需要注意的是在令和8年11月30日之前领取最后一次工资的人。那次年末调整没有反映改革后的扣除，因此需要通过确定申告等进行结算［国税厅 Q＆A Q1-3（日文）］。由于施行日是12月1日，只有在11月画上句号的人被推到了自己申告的一侧。这不是本人的过失，如果有印象，请确认一下源泉征收票。
有副业的人：20万日元规则只是所得税的事
需要做确定申告的工资所得者，典型的有3类［国税厅 No.1900］。
- 工资的年收入金额超过2,000万日元的人
- 从1处领取工资，且工资·退职以外的所得合计超过20万日元的人
- 从2处以上领取工资，且没有做年末调整的工资与工资·退职以外的所得合计超过20万日元的人
第3项最容易被忽略。兼职单位的工资不做年末调整，所以哪怕金额很小，也要把本职以外的工资与副业的所得加在一起判定。
这条"20万日元以下不需要申告"只是所得税上的处理。住民税没有同样的特例，所以不做确定申告的话，向市区町村的住民税申告依然要做。工资所得者的住民税原则上从工资中特别征收，不能按本人意愿选择普通征收［总务省 个人住民税（日文）］。确定申告书上的"自己缴纳"只能用于工资以外的所得［国税厅 确定申告手册（日文）］，如果副业属于"工资"，就会与本职的工资合并后代扣。
副业的所得区分和住民税的处理，在副业的确定申告中有解说。
总结
- 年末调整由公司在12月工资中结算完成,确定申告则由本人在次年2月16日至3月15日向税务署申报。
- 医疗费扣除、捐款扣除、杂项损失扣除,以及住房贷款扣除的首年,都无法通过年末调整处理,必须进行确定申告。
- 工资总额超过2,000万日元的人,以及年中离职且年内未重新就业的人,无法享受年末调整。
- 两者都需要的人,顺序是年末调整→拿到扣缴凭证→确定申告。如果只是为了退税,可在次年1月1日起5年内申报。
- 在令和8年11月30日之前收到最后一笔工资的人,可通过确定申告结算修订后的基础扣除。
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- 国税厅 No.2020 确定申告——申告期间与期限
- 国税厅 No.1900 需要确定申告的工资所得者——超过20万日元·2处工资的判定
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- 国税厅 No.1211-1 住房借入金等特别扣除——第一年与第二年以后
- 国税厅 令和8年4月 源泉所得税改革概要——改革后的扣除额
- 国税厅 基础扣除的提高等相关 Q＆A——施行日与结算方法
- 总务省 故乡纳税 关于税金的扣除——一站式特例
※本文为一般性信息提供。年末调整的实务因公司的做法而异。个别判断请向任职单位、主管税务署、税理士确认。