주택담보대출 공제 2년째 연말정산｜잔액증명서가 필요 없는 사람, 3,000만 엔이면 공제 21만 엔

이 글은 일본어 원문의 번역입니다. 일본어판이 정본이며, 금액은 일본 세법에 따릅니다.

회사원은 2년째부터 회사의 연말정산(年末調整)으로 주택담보대출 공제(住宅ローン控除)를 받을 수 있습니다. 회사에 내는 서류는 세무서의 '공제증명서 겸 신고서'와 금융기관의 '연말잔액증명서' 2장입니다. 다만 잔액증명서가 필요 없는 사람도 있습니다. 2024년 1월 이후에 입주했고, 대출 기관이 '조서 방식'(調書方式)으로 바뀌었으며, 그 기관에 적용신청서를 낸 사람입니다. 공제액은 연말 잔액의 0.7%(레이와 3년 이전 입주는 1%)로, 잔액 3,000만 엔이면 21만 엔입니다. 소득세에서 다 공제하지 못한 부분은 다음 연도 주민세에서 최대 9만 7,500엔까지 공제됩니다[국세청 No.1211-1(일본어)].

2026년 9월 24일부터는 공제증명서를 매년 전자로 받는 데 한 번에 동의하는 절차도 시작되었습니다[국세청 마이나포털 연계 FAQ 문17(일본어)]. 먼저 가지고 있는 봉투를 열어 자신이 어느 방식인지 확인하세요.

결론: 2년째는 '세무서 신고서＋잔액증명서'를 회사에 제출. 조서 방식이면 잔액증명서는 필요 없음

당신의 상황	회사에 내는 서류	도착 시기(기준)
2023년 이전 입주	세무서의 공제증명서 겸 신고서＋금융기관의 연말잔액증명서	잔액증명서는 11월 하순경
2024년 이후 입주・대출 기관이 조서 방식 미대응	위와 같음(기존 증명서 방식)	위와 같음
2024년 이후 입주・대출 기관이 조서 방식・적용신청서 제출 완료	세무서의 공제증명서 겸 신고서만(잔액과 공제 예상액 인쇄)	전자는 11월 중순, 서면은 11월 하순
공제증명서가 늦었다・제출을 잊었다	다음 해 확정신고로 받는다	5년 이내면 소급 가능

출처: 국세청 '조서 방식에 관한 자주 묻는 질문' 문1・문2[국세청(일본어)], '연말정산용 주택담보대출 공제증명서의 교부 시기에 대하여'(2026년 9월)[국세청(일본어)].

1년째는 확정신고, 2년째부터는 연말정산. 2년째 이후는 대출 기관의 방식에 따라 제출 서류가 나뉜다

세무서에서 오는 '공제증명서 겸 신고서' — 2년째 이후 분이 한꺼번에 온다

1년째에 확정신고를 하면 세무서에서 연말정산용 서류가 옵니다. 정식 명칭은 '연말정산을 위한 주택차입금등 특별공제증명서 겸 급여소득자의 주택차입금등 특별공제신고서'입니다. 위쪽 절반은 세무서의 증명, 아래쪽 절반은 당신의 신고란인 한 장짜리 서류입니다.

서면으로 받는 사람: 2년째 이후 연도분이 한꺼번에 우송됩니다. 조서 방식은 입주 2년째 11월 하순경, 증명서 방식은 10월 하순경입니다
전자로 받는 사람: 매년 e-Tax 메시지함에 도착합니다. 조서 방식은 11월 중순경, 증명서 방식은 10월경입니다
묶음에서 해당 연도의 1장을 골라 사용하고, 나머지는 다음 해 이후를 위해 보관합니다
회사가 전자 데이터를 받지 않는 경우 국세청의 'QR코드 부착 증명서 작성 시스템'으로 종이로 출력할 수 있습니다

출처: 국세청 '연말정산용 주택담보대출 공제증명서의 교부 시기에 대하여'[국세청(일본어)], '레이와 8년분 연말정산 방법' 29쪽[국세청(일본어)].

조서 방식인 사람은 서면이냐 전자냐에 따라 3년째 이후의 수고가 달라집니다. 서면 묶음에는 잔액과 공제 예상액이 2년째 분에만 인쇄됩니다. 3년째부터는 상환 예정표를 보고 직접 옮겨 적어야 합니다. 매년 인쇄된 증명서를 받고 싶다면 e-Tax에서 전자 교부에 일괄 동의해 두세요. 기준은 받고 싶은 해의 10월 말까지입니다[국세청 FAQ 문17・17-6(일본어)].

전자 교부에는 마이넘버카드 로그인이 필요합니다. 카드의 전자증명서가 만료되면 사용할 수 없습니다. 갱신 방법은 2026년 마이넘버카드 갱신 러시에 정리했습니다.

잔액증명서가 필요 없는 사람은 누구인가 — '2023년 이후 입주'만으로는 정해지지 않는다

잔액증명서가 필요 없어지는 '조서 방식'은 입주 연도만으로 정해지지 않습니다. 대출 기관의 대응과 본인의 신청이 모두 갖춰져야 쓸 수 있습니다.

법령상으로는 2023(레이와 5)년 1월 1일 이후 입주자부터 조서 방식의 대상입니다. 하지만 금융기관의 시스템 개수가 따라가지 못해 경과 조치가 모든 금융기관에 적용되고 있습니다. 실무에서는 2024년 1월 1일 이후 입주자에 대해 대응을 마친 금융기관부터 차례로 전환하고 있습니다[국세청 자주 묻는 질문 문1(일본어)].

잔액증명서가 필요 없는 사람

2024년 1월 이후에 입주했다
대출 기관이 국세청의 '조서 방식 대응 금융기관 목록'에 있다
대출 기관에 '주택담보대출 공제 적용신청서'(마이넘버 등 기재)를 냈다

여전히 잔액증명서가 필요한 사람

2023년 이전에 입주했다
대출 기관이 아직 조서 방식에 대응하지 않았다
적용신청서를 내지 않았거나 번호를 쓰지 않고 냈다
여러 대출 기관 중 일부만 조서 방식이다(미대응분의 증명서가 필요)

조서 방식에서는 금융기관이 2년째부터 매년 10월 31일까지 연말 잔액을 세무서에 보냅니다[국세청 문7(일본어)]. 그래서 금융기관에서 잔액증명서가 오지 않습니다. '올해는 증명서가 안 왔다'고 당황하기 전에 대출 기관의 안내를 확인하세요.

조서 방식이라도 잔액이 인쇄되지 않는 주요 경우

대출 기관이 2곳 이상이거나 대환대출을 했다
두 주택에서 공제를 겹쳐 받고 있다(중복 적용)
금융기관이 잔액 조서를 정정했다
증명서 방식에서 도중에 전환해 적용신청서를 낸 그 연도분

이때는 상환 예정표 등으로 연말 잔액을 확인해 직접 기입합니다[국세청(일본어)].

신고서 작성법 — '연말 잔액×0.7%'와 공제 한도액 중 작은 쪽을 쓴다

적는 곳은 아래쪽 절반의 ①〜⑥칸입니다. 주택 구분, 취득 대가, 거주용 비율, 연대채무 비율, 한도는 세무서가 위쪽 절반에 인쇄해 두었습니다. 레이와 4년 이후 입주자의 양식은 가로로 Ⓐ주택만・Ⓑ토지 등만・Ⓒ주택 및 토지 등・Ⓓ증개축 등의 4열이 있으며, 잔액증명서의 '주택차입금등의 내역'에서 동그라미가 쳐진 열에 적습니다. 집과 땅을 함께 빌린 사람은 대부분 Ⓒ열입니다.

①칸 연말 잔액을 옮겨 적는다. 증명서 방식은 잔액증명서의 '연말 잔액'을, 조서 방식은 인쇄된 금액을 확인해 적습니다. 대출 기관이 2곳 이상이면 모두 적고, 연대채무 부분은 괄호 안에도 적습니다.
②칸 본인 몫으로 만든다. 단독 대출은 그대로. 연대채무는 위쪽의 '연대채무 비율'을 곱합니다.
③칸 취득 대가와 비교한다. ②와 위쪽 '취득 대가의 금액' 중 적은 쪽을 적습니다.
④칸 거주용 비율을 곱한다. 자택으로만 쓰면 100%로 ③과 같습니다. 점포 겸용이면 인쇄된 비율을 곱합니다.
⑤칸 한도와 비교한다. ④의 합계가 인쇄된 '최고 ○○만 엔'을 넘으면 한도액을 적습니다.
⑥칸 0.7%를 곱하고 100엔 미만은 버린다. 인쇄된 '최고 ○○엔'을 넘으면 한도액을 적습니다.

출처: 국세청 '급여소득자의 주택차입금등 특별공제 신고서 겸 계산명세서 기재례'(레이와 8년분)[국세청(일본어)].

⑤칸 오른쪽의 '연간 소득 예상액'에는 그 해 합계소득금액의 예상치를 적습니다. 조서 방식인 사람은 비고란에 '조서 방식에 대응하는 금융기관으로부터의 차입' 등으로 적습니다. 증명란 아래의 '(참고) 적용 첫해분 공제액'은 각 연도의 공제액이 이를 넘지 않는다는 기준입니다. ⑥칸이 이 금액보다 크면 옮겨 적다가 틀린 곳이 없는지 확인하세요.

레이와 3년 이전에 입주한 사람은 양식이 다르고 공제율은 1%입니다. 국세청 기재례에서 헤이세이 30년 입주 양식은 '⑭칸＝⑪×1%', 레이와 3년 입주는 '⑧칸＝⑤×1%'입니다.

입주 연도	공제율	연말 잔액 한도(신축)	공제 기간	공제받을 수 있는 합계소득
헤이세이 29년〜레이와 원년 9월	1%	4,000만 엔(인정주택 5,000만 엔)	10년	3,000만 엔 이하
레이와 원년 10월〜레이와 3년	1%	4,000만 엔(인정주택 5,000만 엔)	13년(소비세 10%로 취득한 경우 등) 또는 10년	3,000만 엔 이하
레이와 4년・5년	0.7%	인정주택 등은 4,000만〜5,000만 엔, 그 밖의 주택은 3,000만 엔	13년	2,000만 엔 이하
레이와 6년・7년	0.7%	인정주택 등은 3,000만〜4,500만 엔(자녀 양육・젊은 부부 세대는 상향), 그 밖의 주택은 2,000만 엔	13년(그 밖의 주택은 10년)	2,000만 엔 이하

※바닥면적 40제곱미터 이상 50제곱미터 미만 주택은 합계소득 1,000만 엔 이하가 조건. 중고주택・증개축은 한도와 기간이 다름. 레이와 4년 입주라도 계약 시기 특례에 해당하면 1%・13년. 레이와 3년 이전 입주로 13년 공제를 받는 사람은 11년째부터 건물 취득가격(세금 제외)×2%÷3과 비교한 적은 쪽. 레이와 8년도 세제 개정은 레이와 8년 이후 입주분만 바뀌었고, 레이와 7년까지 입주한 사람의 공제율・한도・기간은 그대로. 출처: 국세청 No.1211-1[국세청(일본어)]・No.1212[국세청(일본어)].

계산 예: 2025년 입주・에너지 절약 기준 적합 신축 주택・연말 잔액 3,000만 엔(본 사이트 추산)

공제액＝3,000만 엔×0.7%＝21만 엔(이 구분의 한도액 21만 엔과 같음)
연말정산의 소득세액이 12만 엔이라면 소득세에서 공제되는 것은 12만 엔까지
나머지 9만 엔은 다음 연도 주민세로. 상한은 과세총소득금액 등의 5%와 9만 7,500엔 중 낮은 쪽
과세총소득금액 등이 250만 엔이면 5%는 12만 5,000엔. 상한은 9만 7,500엔이므로 9만 엔 전액이 주민세에서 공제된다

※소득세액 12만 엔・과세총소득금액 등 250만 엔은 설명을 위한 가정입니다. 한도액은 국세청 No.1211-1[국세청(일본어)], 주민세 상한은 총무성[총무성(일본어)].

주민세 부분은 직접 시구정촌에 신고할 필요가 없습니다. 소득세 절차를 마쳤다면 회사의 급여지급보고서를 통해 자동으로 반영됩니다[총무성(일본어)]. 공제 결과는 12월이나 1월 급여에서 환급금으로 돌아옵니다. 돌아오는 시기는 연말정산 환급금은 언제・얼마나 돌아오나에서 확인할 수 있습니다.

연대채무・페어론 — 공제는 '부담 비율과 지분'으로 부부에게 나뉜다

부부가 함께 빌린 경우 공제 대상액은 대출 구성에 따라 나뉩니다. 어느 쪽이든 한 사람의 신고서에 합산해서는 안 됩니다.

페어론(ペアローン): 별개의 대출 2건. 각자 자신의 잔액으로 공제받고, 서류도 1인씩 옵니다
연대채무(連帯債務): 대출 1건을 두 사람이 함께 지는 형태. 부부가 정한 부담 비율과 집의 지분으로 각자의 대상액을 냅니다

연대채무인 사람은 신고서 ①칸에 연말 잔액 전액, ②칸에 연대채무 비율을 곱한 본인 몫을 적습니다. 국세청의 레이와 8년분 기재례에서는 연말 잔액 3,950만 엔・비율 50%로 ②칸은 1,975만 엔, 공제액은 13만 8,200엔입니다(13만 8,250엔의 100엔 미만 버림)[국세청 기재례(일본어)]. 헤이세이 31년(2019년) 이후 입주자의 신고서에는 비율이 인쇄되어 있습니다. 인쇄가 없는 양식이라면 다른 연대채무자가 비고란에 '저는 연대채무자로서 주택차입금등 잔액 ○○엔 중 ○○엔을 부담하기로 했습니다.'라는 문구와 주소・성명(회사원이면 근무처 소재지와 명칭도)을 적어야 합니다[국세청 연말정산 방법 33쪽(일본어)].

국세청의 예에서는 4,000만 엔을 연대채무로 빌리고, 지분은 2분의 1씩, 부담은 남편 6・아내 4였습니다. 남편의 대상은 2,000만 엔, 아내는 1,600만 엔입니다. 남편이 부담한 2,400만 엔 중 자신의 지분을 넘는 400만 엔은 대상이 되지 않습니다[국세청 질의응답 사례(일본어)].

부담 비율은 소득에 따라 합리적으로 정해야 합니다. 구성별 손익은 페어론의 장점과 위험에서 비교했습니다.

제출을 잊었다・증명서를 잃어버렸다 — 확정신고로 5년 소급할 수 있다

연말정산에 늦어도 공제받을 권리는 사라지지 않습니다. 다음 해에 확정신고를 하면 받을 수 있습니다.

잔액증명서가 늦었다: 다음 해 1월 31일까지 도착하면 회사에서 연말정산을 다시 해 줄 수 있습니다[국세청 질의응답 사례(일본어)]
그 이후・제출을 잊었다: 다음 해 확정신고로 받습니다. 환급만 받는 신고는 다음 해 1월 1일부터 5년간 낼 수 있습니다[국세청 No.2030(일본어)]
공제증명서 겸 신고서를 잃어버렸다: 세무서에 '교부신청서'를 내면 재교부됩니다. e-Tax로도 서면으로도 낼 수 있고 기한은 없습니다[국세청 A1-39(일본어)]
잔액증명서를 잃어버렸다: 대출 받은 금융기관에 재발행을 요청합니다

맞지 않는 사람과 함정 — 이직・조기상환・고소득인 해는 주의

다음에 해당하는 해는 연말정산으로 공제를 받을 수 없거나, 받아도 나중에 취소됩니다.

연도 중에 퇴직해 연말에 근무처가 없다: 연말정산 대상이 아닙니다. 다음 해 확정신고로 받습니다
연도 중에 이직했다: 연말에 재직 중인 새 회사에서 연말정산할 수 있습니다. 이전 회사의 원천징수표와 공제증명서 겸 신고서를 함께 냅니다[국세청 No.2665(일본어)]
조기상환으로 상환 기간이 짧아졌다: 첫 상환월부터 마지막 상환월까지 10년 이상이면 계속할 수 있습니다. 10년 미만이 된 해부터는 공제를 받을 수 없습니다[국세청 질의응답 사례(일본어)]
그 해 합계소득이 2,000만 엔을 넘을 것 같다: 그 해분은 공제를 받을 수 없습니다. 레이와 3년 이전 입주자는 3,000만 엔, 바닥면적 40〜50제곱미터 주택은 1,000만 엔이 경계입니다[국세청 No.1211-1(일본어)]
연말에 그 집에 살고 있지 않다: 12월 31일까지 계속 거주하는 것이 요건입니다. 단신부임으로 가족이 계속 살면 받을 수 있습니다. 가족 모두 이사할 때는 살지 않게 되는 날까지 '전임 명령 등으로 거주하지 않게 되는 취지의 신고서'와 쓰지 않은 신고서를 세무서에 내 두면, 돌아와 사는 해 이후 남은 기간 동안 받을 수 있습니다[국세청 No.1234(일본어)]
대환으로 대출액이 늘었다: 새 대출의 당초 금액이 대환 직전 잔액보다 크면 ①칸에 '연말 잔액×대환 직전 잔액÷새 대출의 당초 금액'을 적습니다. 조서 방식이라도 대환 후에는 잔액이 인쇄되지 않습니다[국세청 연말정산 방법 31쪽(일본어)]

'기간 단축형'으로 한꺼번에 갚으면 10년 선을 밑돌기 쉽습니다. 잔액이 줄면 공제액도 줄기 때문에 이자와 공제 중 어느 쪽이 큰지 먼저 비교하세요. 이직한 해의 절차 전체는 이직한 해의 연말정산, 단신부임의 처리는 전근과 주택담보대출 공제에 있습니다.

제도 전체는 주택담보대출 공제 가이드를 보세요.

오늘 할 일

1년째 확정신고 후 받은 공제증명서 묶음(또는 e-Tax 통지)을 찾아 올해 연도분 1장을 확인한다.
대출 기관이 국세청의 '조서 방식 대응 금융기관 목록'에 있는지 조사해 잔액증명서가 올지 확인한다.
올해 조기상환을 한 사람은 상환 예정표에서 마지막 상환월을 보고 첫 상환월부터 10년 이상인지 센다.

정리

회사원은 2년째부터 연말정산으로 받을 수 있다. 회사에 제출하는 것은 세무서의 공제증명서 겸 신고서와 금융기관의 연말잔액 등 증명서다.
2024년 1월 이후 입주했고 대출 기관이 조서 방식으로 적용신청서를 제출한 경우에는 잔액증명서가 불필요하다.
공제액은 연말잔액의 0.7%(레이와 3년 이전 입주는 1%)로, 3,000만 엔이면 21만 엔이다. 소득세에서 다 공제하지 못한 금액은 다음 연도 주민세에서 최대 9만 7,500엔까지 공제된다.
연말정산에 늦더라도 다음 해 확정신고로 5년 이내면 소급할 수 있다.
조기상환으로 상환 기간이 10년 미만이 된 해나, 합산소득이 2,000만 엔을 초과하는 해에는 공제를 받을 수 없다.